More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_40 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  100 
 
 		 398 aa  823    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  35.16 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  33.24 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.52 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.52 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.84 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  30.14 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  29.73 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  28.18 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  27.46 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  27.15 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  27.03 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  24.84 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  26.82 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  24.52 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.31 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.59 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  26.06 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  26.69 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 		 420 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  26.33 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  26.8 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  26.86 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.28 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  26.86 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  24.23 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.23 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  24.15 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.66 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  31.55 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.65 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  27.4 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  25.56 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.1 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  24.14 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.35 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  23.96 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  24.36 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.18 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.13 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.08 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  28.87 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.85 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  24.68 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  26.21 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  24.63 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.47 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  22.52 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  25.37 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  24.54 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  30.4 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  23.46 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  24.22 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  24.58 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  26.24 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.57 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  26.24 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  30.23 
 
 		 255 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  25.08 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  24.13 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  23.91 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  26.24 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  24.31 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  26.64 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.49 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.65 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  26.64 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.13 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  26.24 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.23 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  23.12 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  24.89 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>