More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0126 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  100 
 
 
401 aa  821    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  57.87 
 
 
399 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.83 
 
 
405 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  28.53 
 
 
405 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  29.51 
 
 
407 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  28.27 
 
 
405 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  26.37 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  25.94 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  26.52 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  26.52 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  26.52 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.53 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  25.87 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.26 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  28.3 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  34.01 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  25.76 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  27.72 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.53 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.44 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  31.55 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  24.92 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  26.21 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.87 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  29.71 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  27.56 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.33 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.16 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  30.84 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  33.18 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 
253 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
254 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.33 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  28.92 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  27.05 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
277 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  27.05 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  26.94 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.82 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  26.38 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 
284 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.73 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.81 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.73 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  32.72 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.81 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  27.65 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  32.14 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  25.81 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  28.98 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  34.91 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  26.53 
 
 
254 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.13 
 
 
259 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  28.64 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  30.39 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>