More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2994 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
280 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.81 
 
 
292 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.81 
 
 
296 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.26 
 
 
291 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.1 
 
 
288 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  63.54 
 
 
296 aa  324  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.8 
 
 
291 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.9 
 
 
291 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.25 
 
 
294 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63 
 
 
288 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.82 
 
 
291 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  64.1 
 
 
291 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.82 
 
 
291 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.07 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.51 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  52.06 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  53.76 
 
 
288 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  53.93 
 
 
286 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  43.37 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  42.11 
 
 
293 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.46 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  38.35 
 
 
288 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  38.35 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  42.81 
 
 
308 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  41.72 
 
 
308 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.1 
 
 
294 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  39.13 
 
 
235 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.83 
 
 
462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  36.67 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.89 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.13 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.1 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.75 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.89 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.29 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.39 
 
 
258 aa  79  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.13 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.88 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  34.97 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  33.13 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  33.13 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.1 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  33.72 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  31.9 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.53 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  34.19 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  32.9 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  35.53 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.09 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  32.35 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  25.71 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  30.8 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  35.56 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.74 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.26 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.42 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.38 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.39 
 
 
302 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>