71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0480 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.9 
 
 
287 aa  294  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  44.21 
 
 
296 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.51 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.16 
 
 
291 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.36 
 
 
291 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.8 
 
 
291 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  44.8 
 
 
291 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.57 
 
 
283 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.8 
 
 
291 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.81 
 
 
288 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.93 
 
 
294 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.01 
 
 
291 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.36 
 
 
292 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.04 
 
 
280 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 
296 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  33.58 
 
 
286 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  35.87 
 
 
288 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  35.74 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  30.24 
 
 
293 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  36.59 
 
 
295 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  38.89 
 
 
294 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  34.19 
 
 
288 aa  98.6  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  33.55 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.25 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  37.11 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  35.85 
 
 
308 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
462 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.26 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  31.03 
 
 
751 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.93 
 
 
371 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
249 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  50 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  28.57 
 
 
397 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  50 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  28.57 
 
 
397 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  29.63 
 
 
405 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  30.66 
 
 
403 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  29.92 
 
 
744 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46 
 
 
313 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.25 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.58 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  31.58 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
303 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 
322 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.35 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  30.71 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0282  hypothetical protein  42.22 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00050925  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  29.58 
 
 
409 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  29.79 
 
 
402 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 
263 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  27.47 
 
 
263 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.33 
 
 
257 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.16 
 
 
253 aa  42  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  28.89 
 
 
405 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  29.32 
 
 
258 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  28.35 
 
 
744 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
303 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 
329 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.98 
 
 
255 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>