More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  97.54 
 
 
286 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  63.6 
 
 
286 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.11 
 
 
291 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.93 
 
 
291 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 
291 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  55.56 
 
 
291 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 
291 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.81 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.92 
 
 
288 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  52.55 
 
 
296 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.43 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.11 
 
 
283 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.09 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 
292 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.76 
 
 
280 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.94 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  41.38 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  40.67 
 
 
288 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  43.21 
 
 
293 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  40.3 
 
 
283 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  41.43 
 
 
308 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.6 
 
 
294 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  40.93 
 
 
308 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.28 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.1 
 
 
294 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
462 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  34.78 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.12 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.66 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.57 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.19 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  29.39 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.12 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  28.29 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  27.54 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  30.57 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.41 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.07 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  27.38 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.38 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.01 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.1 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  31.78 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.41 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  29.24 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  27.73 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.51 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  27.88 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  35.37 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  30.54 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  26.69 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.59 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  29.23 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  30.14 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  28 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.27 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.62 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.62 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 
271 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>