More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0045 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0045  Slp  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  99.16 
 
 		 241 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1633  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.72 
 
 		 245 aa  351  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  35.97 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.52 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  36.08 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  36.08 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 317 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.8 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.2 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.37 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  31.6 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 		 329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  35.77 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.44 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  33.99 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  33.59 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  31.2 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  33.72 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.55 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  34.63 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  34 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.92 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 269 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  30.68 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 339 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  33.47 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 303 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 		 337 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 		 336 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.86 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  35.69 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  36.11 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 		 330 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 		 433 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.43 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  34.17 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.14 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.06 
 
 		 332 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  33.88 
 
 		 315 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.84 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.63 
 
 		 326 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  32.17 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.27 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  31.15 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 437 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.64 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.57 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 		 470 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.63 
 
 		 392 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 352 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.74 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  32.38 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.98 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>