More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1230 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  100 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.81 
 
 
291 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.47 
 
 
291 aa  507  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.41 
 
 
291 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  91.07 
 
 
291 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.07 
 
 
291 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.14 
 
 
288 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.41 
 
 
288 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  81.72 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.09 
 
 
283 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.74 
 
 
294 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.74 
 
 
287 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.1 
 
 
280 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.21 
 
 
292 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.86 
 
 
296 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  53.14 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  55.56 
 
 
288 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  55.72 
 
 
286 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  42.71 
 
 
293 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.34 
 
 
273 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  40.85 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.05 
 
 
294 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  38.15 
 
 
288 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  37.41 
 
 
283 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  39.73 
 
 
308 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  43.37 
 
 
235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  38.7 
 
 
308 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.68 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.72 
 
 
462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.88 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  37.21 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.24 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  35.37 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.72 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.85 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.98 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.09 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.14 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  29.04 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.07 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  31.29 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.97 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.34 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.06 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.67 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.58 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  34.39 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.07 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  33.55 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  28.51 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  31.4 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.96 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  33.76 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.55 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.09 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.71 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  27.4 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>