More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0073 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  49.8 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.12 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.53 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.75 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  46.96 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.35 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.35 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.77 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.08 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.69 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  37.75 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  36.84 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.27 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  36.76 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  27.2 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  39.19 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.02 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.23 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  32.14 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  39.33 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 		 352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.96 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  40.14 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.85 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  29.44 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.35 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.16 
 
 		 319 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.67 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  29.88 
 
 		 332 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.35 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.46 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.46 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.51 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.37 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  30.95 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.11 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  28.11 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  31.01 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  32.82 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  30.49 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.85 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.19 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  28.92 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  38 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  29.73 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  34 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  31.16 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.29 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  29.73 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  35.14 
 
 		 420 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 		 337 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.94 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.83 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  34.27 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  34.55 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  29.92 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  33.56 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.36 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 404 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>