More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1300 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.96 
 
 		 246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.27 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.43 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  69.29 
 
 		 248 aa  362  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.76 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  67.22 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.53 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  44.31 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  40.5 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.63 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.53 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.74 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.96 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  38.37 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.55 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  29.69 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  31.85 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  31.47 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  30.4 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.23 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.6 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  30.16 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.27 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.56 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.47 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.8 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  27.56 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.07 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  29.69 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.2 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  29.37 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.24 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  27.31 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.29 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  27.78 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.89 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  27.49 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.37 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 		 273 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  31.08 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.67 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.67 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.82 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  28.85 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 		 286 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  29.27 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  26.92 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  30.88 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  28.85 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.64 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  28.19 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 		 317 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.46 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.46 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>