More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0978 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.42 
 
 
249 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  66.39 
 
 
248 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.14 
 
 
249 aa  345  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.22 
 
 
246 aa  343  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.54 
 
 
246 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.22 
 
 
246 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.96 
 
 
249 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  42.28 
 
 
250 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  43.37 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.72 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.05 
 
 
257 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
248 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.78 
 
 
249 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  38.43 
 
 
249 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 
253 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.17 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
254 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 
257 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
268 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 
256 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 
255 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 
255 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
294 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
270 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
282 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 
253 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 
257 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
268 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 
287 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
253 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  28.52 
 
 
283 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  27.06 
 
 
259 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
262 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
270 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  28.46 
 
 
254 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
284 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 
252 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
253 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
269 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  28 
 
 
348 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  27.78 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
284 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
329 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  27.31 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  28.81 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  25.79 
 
 
319 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  26.4 
 
 
294 aa  97.1  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
284 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  30.08 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 
286 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  29.2 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 
289 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  26.59 
 
 
327 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.76 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
317 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  28.46 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
259 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  25.79 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.72 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  28.05 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  25.6 
 
 
276 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  27.2 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
317 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  26.32 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.6 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.69 
 
 
329 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  27.65 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>