More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1270 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.43 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.43 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.38 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  70.08 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.92 
 
 		 249 aa  358  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  68.42 
 
 		 248 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.75 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  43.09 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  41.98 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.03 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.98 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.16 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.43 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  38.68 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  37.67 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  26.91 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  37.67 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 		 294 aa  92  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  31.97 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.11 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.49 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.97 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  31.97 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  26.4 
 
 		 348 aa  89.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  27.49 
 
 		 315 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  31.97 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  34.25 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  33.1 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.19 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  25.1 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  30.28 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.6 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  28.92 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.21 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.02 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.57 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  26.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  25.81 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.71 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  28.8 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  28.8 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.6 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.79 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  27.49 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.19 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  32.19 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  29.57 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  28.24 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  27.69 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  29.93 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  28.92 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.42 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  35.14 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>