More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3056 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.39 
 
 
246 aa  221  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  46.75 
 
 
254 aa  218  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  42.28 
 
 
248 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.98 
 
 
249 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.6 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  39.75 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.33 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.24 
 
 
249 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.39 
 
 
249 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.6 
 
 
249 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.89 
 
 
248 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.51 
 
 
257 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
249 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  37.86 
 
 
249 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
256 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
303 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 
299 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  31.52 
 
 
259 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.89 
 
 
287 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.39 
 
 
256 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
329 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
253 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
303 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
273 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  32.82 
 
 
314 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.1 
 
 
257 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
253 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.42 
 
 
279 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  31.37 
 
 
332 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  31.01 
 
 
283 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.08 
 
 
336 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  32.38 
 
 
261 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.02 
 
 
284 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.27 
 
 
329 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
284 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  30.31 
 
 
293 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  35.29 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.74 
 
 
348 aa  99.4  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
253 aa  99  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  31.27 
 
 
258 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.17 
 
 
279 aa  98.6  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  31.98 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  34.48 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  32 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
362 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  34.48 
 
 
335 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  34.48 
 
 
335 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
337 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  28.08 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.55 
 
 
318 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  31.02 
 
 
268 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.17 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 
284 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
271 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
322 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  28.74 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  29.59 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  27.95 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  28.79 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.12 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
253 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
261 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.17 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  30.2 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.76 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>