More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1534 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  62.59 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  63.6 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.45 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.54 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.64 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  51.64 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.08 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  53.14 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.36 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.06 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.14 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.14 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.71 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.77 
 
 		 291 aa  258  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.29 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  42.91 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  40.85 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  40.07 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  39.71 
 
 		 283 aa  215  9e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.01 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  39.72 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  39.72 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.54 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.92 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 		 462 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  33.58 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  27.49 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  28.81 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  27.38 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.99 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  26.8 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.4 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.1 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.18 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.82 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.62 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.73 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  26.1 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  27.78 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3056  ParaA family ATPase  31.55 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  26.12 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.83 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  26.12 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.48 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  31.14 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  31.47 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  27.59 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  25.8 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.59 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  25.8 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.09 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.67 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.01 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>