More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4437 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  97.54 
 
 		 288 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  62.59 
 
 		 286 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.09 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.27 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.64 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  55.72 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.72 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.73 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  52.36 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.81 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.92 
 
 		 283 aa  265  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.37 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.91 
 
 		 287 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.34 
 
 		 296 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.93 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  41.38 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  40.3 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  42.81 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  39.93 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  40.71 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  41.52 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  40.21 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 		 462 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  34.66 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.49 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  32.08 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.58 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  27.67 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  28.57 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  27.08 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  28.4 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.05 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  28.68 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.83 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  29.69 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.66 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  28.79 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.46 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  28.4 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.88 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  27.31 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  28.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  36.02 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.63 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.63 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.39 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.05 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  25.3 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  25.51 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.52 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.93 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.93 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>