More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1666 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  71.63 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.28 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.1 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.72 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.1 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  71.74 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.01 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.38 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.04 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.93 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.71 
 
 		 294 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  59.86 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.05 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.51 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  51.09 
 
 		 288 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  48 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  50.91 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  42.76 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.01 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  41.11 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.1 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  35.59 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  35.59 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  39.31 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 		 462 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.55 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.98 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  34.55 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  35.37 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.93 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  31.91 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.39 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  33.55 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.84 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  33.55 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.75 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.26 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  33.7 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  33.16 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  29.46 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  29.86 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  33.76 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  33.76 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.52 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.76 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.53 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.9 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  30.97 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.79 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>