More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0636 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  89.93 
 
 		 288 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  89.58 
 
 		 296 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  84.14 
 
 		 291 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.23 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.23 
 
 		 291 aa  447  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83.45 
 
 		 291 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.23 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83.1 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.72 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.57 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.72 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.1 
 
 		 280 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.45 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.78 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  51.64 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  52.92 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  52.73 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  44.17 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.33 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  41.7 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  42.2 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  40.97 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  40.28 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  37.41 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  37.41 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  41.75 
 
 		 235 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.97 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.68 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.37 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  34.15 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  34.97 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.48 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  34.76 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.37 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.54 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  29.41 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  29.33 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  27.44 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  28.42 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  33.55 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  31.9 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  28.16 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.56 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  29.12 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  24.79 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  30.06 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  29.37 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  31.11 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.67 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.17 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.86 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  29.7 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  33.33 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  29.45 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  27.73 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.45 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>