More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3286 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  88.5 
 
 		 292 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.81 
 
 		 280 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  57.3 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.08 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.15 
 
 		 288 aa  281  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.72 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.73 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.34 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  55.86 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.78 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.05 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.04 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  48.71 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  48.34 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  47.94 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  42.67 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  41.92 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  37.04 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  43.57 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  37.04 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  43.21 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  43.77 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.48 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.97 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  34.8 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.57 
 
 		 462 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 362 aa  89  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.11 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  32.98 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.24 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.29 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  32.98 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  28.89 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.61 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.87 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  26.86 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  26.09 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  27.66 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  24.58 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.28 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  34.13 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  28.17 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.64 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  28.34 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  25.96 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  28.57 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  29.28 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  27.54 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  30.77 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.97 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  29.04 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  30.54 
 
 		 248 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  25.11 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.47 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  30.92 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.97 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>