More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4116 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  91.78 
 
 		 308 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  64.06 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  64.54 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  63.96 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  41.43 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  39.72 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  40.71 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.47 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.28 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.21 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  39.18 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.93 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.83 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.81 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.64 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  38.36 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.81 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.14 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.85 
 
 		 291 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  36.64 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  36.77 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.06 
 
 		 462 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  35.22 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  34.59 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.32 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  32.95 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.11 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  27.4 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  31.72 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.3 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.87 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  27.92 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  26.98 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.81 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.28 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  27.8 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  35.16 
 
 		 782 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.71 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  32.99 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  26.63 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.45 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  32.91 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  36.43 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.07 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.78 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.65 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  30.95 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.98 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.75 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.41 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>