More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0301 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  91.78 
 
 		 308 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  62.77 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  63.96 
 
 		 293 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  63.73 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  39.72 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  40.93 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  40.21 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.57 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.32 
 
 		 294 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  40.82 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.21 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.62 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.27 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.56 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.52 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.24 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.72 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.18 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  39.38 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.31 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  36.79 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  36.24 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.68 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.7 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  33.96 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.72 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  26.74 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  30.71 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.61 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  30.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.97 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.4 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.71 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.54 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  27.38 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  33.59 
 
 		 782 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  27.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.3 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  25.89 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  32.52 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  30.67 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.35 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  26.51 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.39 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  27.49 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.92 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.53 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.68 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  45.71 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  26.15 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.67 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  35.1 
 
 		 779 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  32.03 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  30.97 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.3 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  31.5 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 		 492 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  31.5 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 		 721 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>