More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2506 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.79 
 
 
272 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.97 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  33.59 
 
 
258 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  33.96 
 
 
370 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
266 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.59 
 
 
332 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.21 
 
 
255 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  33.59 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  33.71 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.32 
 
 
253 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  33.84 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.68 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.73 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.5 
 
 
258 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
339 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  33.59 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 
262 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 
336 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
282 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  32.84 
 
 
315 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
392 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  32.21 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 
470 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
335 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.57 
 
 
255 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
335 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
333 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.35 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  31.94 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  33.21 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.11 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  35.5 
 
 
254 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  33.72 
 
 
345 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.52 
 
 
299 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  32.06 
 
 
347 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  32.82 
 
 
256 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 
256 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  34.35 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.53 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
276 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.94 
 
 
257 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  33.85 
 
 
330 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
256 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
273 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  32.43 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.11 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  32.57 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  31.3 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.66 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  33.59 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.05 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.14 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  34.6 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 
255 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
289 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.45 
 
 
273 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
284 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 
433 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.34 
 
 
257 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.6 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  31.42 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.09 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  32.44 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.95 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.33 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>