More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5835 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  93.51 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  70.23 
 
 		 262 aa  362  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  40.08 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  38.89 
 
 		 381 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  35.55 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  37.6 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  37.4 
 
 		 271 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  37.07 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  35.47 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  33.99 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  33.73 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.93 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.93 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.72 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.32 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  32.14 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  31.25 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.75 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  32.06 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  32.75 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  32.75 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  32.39 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  32.39 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  32.39 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  30.45 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  25.88 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  28.85 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  31.2 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  27.71 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  27.71 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  29.51 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  29.51 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.93 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  27.53 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  27.31 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  27.76 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6366  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  27.31 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  27.31 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  27.31 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  26.91 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  30.2 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.29 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  27.5 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.5 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  26.17 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  28.09 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  27.55 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.14 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  26.19 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  27.87 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.88 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.88 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  26.95 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.28 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.09 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.61 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  26.36 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  26.88 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26.47 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.75 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.53 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  27.17 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.8 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  28.36 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.81 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>