140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3198 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  88.51 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  88.09 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  37.92 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  38.33 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  38.17 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  37.55 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  36.67 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  36.67 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  36.25 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  36.25 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  32.5 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  32.5 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  32.5 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  32.5 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  35.98 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.47 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  31.6 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.45 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  29.72 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.45 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  26.59 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  25.83 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  30.83 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  24.89 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  22.16 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.08 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  20.8 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.18 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.7 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  26.29 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.59 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.36 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.2 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.16 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  27.89 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  28.28 
 
 		 381 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  26.46 
 
 		 319 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  28.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  22.73 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.43 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.43 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.01 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  24.31 
 
 		 318 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.2 
 
 		 302 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  23.53 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.88 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.79 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  27.71 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.35 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  26.47 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.2 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.6 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 420 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  27.76 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26.38 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.4 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.4 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.4 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.14 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  22.67 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  26.38 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.2 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  23.2 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  23.2 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.61 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  45.1  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 		 326 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.17 
 
 		 284 aa  45.1  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  20.38 
 
 		 256 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.23 
 
 		 307 aa  45.1  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 		 337 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  23.2 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  23.57 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.98 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.49 
 
 		 303 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  27.14 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  28.93 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.05 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>