112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3522 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  58.06 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  46.72 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  46.72 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  45.95 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  47.49 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.62 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  44.62 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  46.77 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  42.91 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  42.91 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  42.55 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  42.55 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  42.55 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  46.03 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  40.24 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  34.66 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  33.99 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.76 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  28.46 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  30.08 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.65 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.38 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  29.34 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  28.06 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.45 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.94 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  23.9 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  26.51 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  26.51 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  26.51 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  22.36 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  27.2 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.2 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  26.1 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.29 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  26.69 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  25.69 
 
 		 408 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.4 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  25.5 
 
 		 408 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.14 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.2 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.19 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  28.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  26.82 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.35 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  25.1 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  25.1 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.58 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  25.1 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  25.5 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  25.1 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.1 
 
 		 405 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.96 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  26.05 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.22 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.83 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.45 
 
 		 404 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.53 
 
 		 400 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.18 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.33 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  23.86 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  24.7 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  27.12 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.9 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  25.87 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6366  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  23.85 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  24.54 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.37 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  28.57 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  24.28 
 
 		 460 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  23.04 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  26.14 
 
 		 464 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  25.1 
 
 		 408 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.78 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  26.38 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  37.25 
 
 		 371 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  26.87 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  24.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  41.38 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.97 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.7 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>