51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0179 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  98.76 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  99.59 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  99.59 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  98.76 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  99.17 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  77.08 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  77.08 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  77.08 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  77.08 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  76.25 
 
 		 250 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  69.2 
 
 		 250 aa  345  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  51.52 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  54.2 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  50.42 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  33.19 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  33.91 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  31.47 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  29.63 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.75 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.5 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  26.25 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.16 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  27.98 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  26.36 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.41 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  29.12 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.07 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  25.21 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  28.06 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.39 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.81 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  25.95 
 
 		 460 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  25.69 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  20.58 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 446 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  25.9 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276927  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  25.6 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 285 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.22 
 
 		 265 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>