70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0077 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  95.1 
 
 		 245 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  61.89 
 
 		 245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  51.63 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  51.63 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  50.81 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  50.81 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  50.81 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  51.63 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  51.22 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  50.41 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  50.81 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  52.72 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  50.42 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  50.63 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  38.17 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  36.55 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  36.55 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.95 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  32.24 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.32 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  29.18 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  28.4 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  27.35 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  25 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  28.51 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.67 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.47 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  25.51 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  25.82 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.82 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  25.1 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  25.82 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  25.15 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.89 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  26.45 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.35 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.39 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  26.95 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.21 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  25.63 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  25.41 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  26.83 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.86 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  26.84 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  25 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.21 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.21 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.53 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  23.77 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.67 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  25.31 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  27.05 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.85 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.89 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  24.6 
 
 		 416 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.71 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.81 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  26.49 
 
 		 332 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 		 330 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 		 274 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.22 
 
 		 322 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>