85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0147 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  61.89 
 
 
245 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  61.89 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  54.47 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  54.47 
 
 
250 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  54.47 
 
 
250 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  54.07 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  56.1 
 
 
250 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  56.1 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  56.1 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  55.69 
 
 
250 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  56.38 
 
 
250 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  54.2 
 
 
242 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  54.43 
 
 
241 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  51.88 
 
 
250 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  39 
 
 
235 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  35.83 
 
 
235 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  35.83 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  30.47 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.25 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  33.33 
 
 
263 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.77 
 
 
262 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.04 
 
 
265 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  30.12 
 
 
267 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  28.96 
 
 
381 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  28.8 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.22 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  27.87 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  27.69 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.46 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.46 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  27.46 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  25.91 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.98 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  27.46 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 
274 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  25.51 
 
 
262 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.18 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  20.67 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1270  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.75 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  27.24 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  24.14 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  27.64 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.59 
 
 
299 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.72 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  24.72 
 
 
264 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.05 
 
 
302 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.83 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.63 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0978  ParaA family ATPase  24.12 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.576482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
329 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.82 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
264 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 
329 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.8 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  20.99 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1300  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.08 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.845132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1011  cell division ATPase MinD  25.88 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.381941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.8 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.94 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  23.33 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  23.41 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  25.79 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.64 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  32.48 
 
 
747 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.92 
 
 
367 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  22.22 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  27.98 
 
 
394 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  24.29 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.95 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
257 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  23.58 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  25.79 
 
 
271 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
297 aa  42  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0570  hypothetical protein  24.05 
 
 
305 aa  42  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>