274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1026 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  100 
 
 		 381 aa  770    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  37.55 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  38.89 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  36.84 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  35.08 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  28.1 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.67 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  28.96 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.18 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.51 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.9 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  28.44 
 
 		 250 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  26.91 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  26.46 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  26.46 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  26.46 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  26.46 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  25.99 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  25.99 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  25.99 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  26.36 
 
 		 241 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.36 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  25.55 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G08  stage 0 sporulation protein J  24.18 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000611583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  26.62 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  22.61 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.57 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  27.97 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.46 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  26.64 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 		 257 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  24.24 
 
 		 280 aa  54.3  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.27 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  26.15 
 
 		 259 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 240 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 260 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 306 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 		 249 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.04 
 
 		 251 aa  53.1  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  28.5 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  30.22 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.71 
 
 		 268 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  26.29 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.29 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.16 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.5 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  23.88 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  29.49 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  31.71 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  24.62 
 
 		 259 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.69 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 		 255 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.04 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  29.14 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.2 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  26.21 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  20.35 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 252 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  21.27 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.28 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  25.97 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  28.02 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.97 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.55 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  25.2 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.83 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  32.32 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.18 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  29.1 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  28.06 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  24.35 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.65 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  25.21 
 
 		 253 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.29 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  32.04 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>