More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1128 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.11 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  36.86 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 		 392 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.58 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  37.35 
 
 		 330 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  37.84 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  36.68 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.26 
 
 		 410 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  34.26 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.93 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.28 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.74 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  35.69 
 
 		 323 aa  168  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.11 
 
 		 437 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  38.02 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.43 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 		 470 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.46 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.46 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 		 339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  36.23 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.25 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  33.6 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  36.78 
 
 		 341 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.16 
 
 		 452 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.06 
 
 		 314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  39.13 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  35.37 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  36.61 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.19 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.94 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  37.3 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.13 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.64 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  36.59 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  36.33 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.2 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  37.6 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  37.2 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.24 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.2 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  35.71 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  35.71 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.6 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.82 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  35.71 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  37.6 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  37.65 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  37.6 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  37.6 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  34.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.19 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  36.82 
 
 		 361 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.75 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.8 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.65 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.64 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  39.2 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.04 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  35.22 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  35.18 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.74 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  35.55 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.39 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.26 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  35.5 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  34.65 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  37.75 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  34.12 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.06 
 
 		 301 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.8 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  37.07 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  34.13 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  37.75 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>