More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2546 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.03 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.39 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 352 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  35.89 
 
 		 314 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.08 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.79 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.4 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.98 
 
 		 293 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 303 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 309 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  32.26 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.17 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.36 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  30.24 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  31.05 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  31.62 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.78 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  32.26 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.05 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 		 262 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.63 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  29.03 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  29.84 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.51 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 299 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  31.02 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.84 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  29.55 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  26.72 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  27.09 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 317 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.09 
 
 		 348 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.12 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.72 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.63 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.17 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  28.46 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.61 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>