78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2255 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  58.47 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  43.6 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  44 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  44.66 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.27 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  44.27 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  44.98 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  43.48 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  44 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  40.58 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  40.58 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  40.58 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  40.58 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  40.58 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  38.22 
 
 		 271 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  31.68 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  32.42 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.92 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  28.46 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.27 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.46 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  27.31 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.94 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  23.25 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  27.67 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.77 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  29.51 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  23.84 
 
 		 371 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.21 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.69 
 
 		 408 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.11 
 
 		 397 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  21.65 
 
 		 408 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  25 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  23.11 
 
 		 397 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.41 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.18 
 
 		 398 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  28.05 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.8 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.08 
 
 		 404 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.87 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.03 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.03 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.34 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  26.64 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 		 395 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  22.69 
 
 		 397 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  22.63 
 
 		 397 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  25.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  25.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  26.23 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  22.26 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5285  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.43 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  23.72 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.88 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  27.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  25.78 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  25.41 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.43 
 
 		 420 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  31.82 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  27.5 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  25.75 
 
 		 409 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.92 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.38 
 
 		 366 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  37.5 
 
 		 263 aa  42  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  26.04 
 
 		 464 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 		 241 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.69 
 
 		 257 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799801 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  24.31 
 
 		 398 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>