102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1296 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  98.47 
 
 
262 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  90.84 
 
 
259 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  90.84 
 
 
259 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  90.46 
 
 
259 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  90.4 
 
 
259 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  83.59 
 
 
259 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  71.71 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  63.54 
 
 
287 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  63.54 
 
 
287 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 
287 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 
287 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 
287 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  61.6 
 
 
271 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  44.27 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  44.49 
 
 
263 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  32.69 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  32.14 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.03 
 
 
262 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  31.25 
 
 
263 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  27.06 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.19 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.73 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.51 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  24.29 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  25.47 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  24.18 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.02 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  25.91 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  24.4 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  26.38 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.75 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  25.98 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  25.98 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  25.98 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  25.59 
 
 
250 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.79 
 
 
383 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  25.5 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  30.15 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0974  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467383  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  28.14 
 
 
464 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0990  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.56 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  25 
 
 
381 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  26.5 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  26.5 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  24.11 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  23.72 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  23.72 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.66 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  26.56 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0871  ParA family protein  27.42 
 
 
255 aa  45.4  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.401351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  26.56 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  27.17 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  26.02 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  21.7 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  46.94 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  46.94 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  24.69 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.69 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.19 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  24.28 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  43.9 
 
 
460 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.68 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.35 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  23.53 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  23.32 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  46.94 
 
 
405 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  22.84 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.75 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.79 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  55.26 
 
 
391 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  29.41 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.49 
 
 
294 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  53.66 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0704  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.5 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  47.06 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  28.48 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  27.84 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  23.64 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.9 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  27.13 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.63 
 
 
272 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  50 
 
 
269 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  50 
 
 
269 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>