More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3070 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.79 
 
 
273 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  37.79 
 
 
273 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  38.17 
 
 
265 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.31 
 
 
264 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  34.59 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.78 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  32.83 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.91 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.6 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 
262 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  32.7 
 
 
262 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  32.7 
 
 
262 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  34.1 
 
 
256 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  34.1 
 
 
256 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
259 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 
263 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  32.32 
 
 
262 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.96 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.66 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  35.5 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  32.34 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  35.88 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.63 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  31.8 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.88 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.17 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
257 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.87 
 
 
277 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  31.68 
 
 
262 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.11 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.21 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  31.42 
 
 
257 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  33.33 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  32.58 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.9 
 
 
253 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
268 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  34.1 
 
 
294 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 
266 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  36.23 
 
 
319 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  33.2 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
264 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
273 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  33.2 
 
 
262 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
257 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
254 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
255 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.98 
 
 
293 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  32.43 
 
 
263 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
253 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
253 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 
284 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.8 
 
 
280 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
282 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  34.47 
 
 
257 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.27 
 
 
269 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  34.35 
 
 
259 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  34.51 
 
 
261 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
261 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
262 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
317 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 
293 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
392 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.31 
 
 
253 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  33.46 
 
 
318 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.09 
 
 
298 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.3 
 
 
268 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
269 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
257 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
257 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.62 
 
 
257 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.83 
 
 
258 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>