36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0933 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  534  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  29.84 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  27.56 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  27.56 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  27.56 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.64 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  27.17 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  27.76 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.31 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.88 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  25.88 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.49 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.4 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  28.11 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  26.54 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  26.15 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  26.15 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  26.15 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  26.54 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  25.2 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  26.59 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  25 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  25 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  23.95 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.2 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  25.2 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  23.13 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  24.8 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  24.51 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  22.87 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  23.65 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  25.2 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  25.19 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  24.15 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  22.39 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>