98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1262 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  100 
 
 		 262 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  98.47 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  90.08 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  89.69 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  90.08 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  89.2 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  82.44 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  70.52 
 
 		 261 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  63.54 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  63.54 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  63.18 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  61.6 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  43.87 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  44.49 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  31.92 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.75 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.62 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  29.96 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  26.59 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.73 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.73 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.1 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  23.89 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.76 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.12 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  23.58 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  24.44 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  25.51 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0990  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0974  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  24 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  25.98 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  25.76 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  25.59 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  25.59 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  25.59 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.79 
 
 		 383 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.65 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.79 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.41 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  25.2 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  28.14 
 
 		 464 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  28.35 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  24.24 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  27.17 
 
 		 235 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.75 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  26.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  26.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  56.1 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.2 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  39.44 
 
 		 460 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  31.62 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.86 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.19 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.9 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.68 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0871  ParA family protein  27.42 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.401351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.23 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  23.32 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.5 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.18 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.64 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 444 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  29.38 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.21 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  23.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  23.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.35 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.56 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  42.86 
 
 		 261 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  22.45 
 
 		 269 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  44.9 
 
 		 405 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 294 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  44.9 
 
 		 405 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>