More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3579 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  97.38 
 
 
229 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.94 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  89.67 
 
 
215 aa  400  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  44.55 
 
 
267 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  45.28 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  41.63 
 
 
249 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.45 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.91 
 
 
240 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.33 
 
 
240 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.81 
 
 
241 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
232 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  30.66 
 
 
309 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
219 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
223 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  30.2 
 
 
221 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.34 
 
 
223 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
211 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 
220 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.85 
 
 
216 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
234 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
215 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.18 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.19 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
212 aa  89  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  28.84 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  33.18 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.79 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.92 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 
209 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  34.07 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  31.78 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  31.31 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  32.34 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  32.76 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  36 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.97 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.97 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.68 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  34.96 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  30.35 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.35 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  28.36 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.91 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.27 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  27.8 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  28.97 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.67 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  28.64 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.73 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  28.11 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>