More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1506 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
274 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
259 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
262 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.12 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  31.98 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  34.9 
 
 
333 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  34.9 
 
 
335 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  34.9 
 
 
335 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.58 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
256 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 
437 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
256 aa  125  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
254 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
336 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
433 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
256 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
256 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.69 
 
 
256 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 
318 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
251 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  29.02 
 
 
323 aa  123  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  33.47 
 
 
262 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
339 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 
255 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.35 
 
 
317 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  30.52 
 
 
265 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.54 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  31.52 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  30.68 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  31.85 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  30.24 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.2 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
470 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  31.87 
 
 
257 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 
261 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 
303 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  30.4 
 
 
265 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
269 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
263 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  33.6 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
462 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.67 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
249 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 
262 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 
298 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  30.71 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.8 
 
 
258 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.86 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  32.68 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  30.92 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  32.16 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  27.78 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  27.78 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.2 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
257 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  30.92 
 
 
258 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  31.13 
 
 
262 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
257 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
279 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
367 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.53 
 
 
337 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34 
 
 
290 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.68 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.79 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  32.14 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  32 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  32.67 
 
 
265 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>