More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3439 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  38.46 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 
232 aa  134  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.65 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.12 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  37.32 
 
 
267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
226 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.51 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.97 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
226 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.35 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
224 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
216 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.5 
 
 
225 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
216 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  33.96 
 
 
221 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
221 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 
223 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 
229 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 
215 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 
229 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 
229 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 
219 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  34.47 
 
 
249 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.5 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.43 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.54 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.98 
 
 
309 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.64 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.51 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.24 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  34.88 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.77 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.63 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  35.83 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.45 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.45 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.26 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  35.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.12 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.57 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.25 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.26 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  29.7 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  29.21 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  27.72 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  29.21 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.18 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  31.55 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  29.72 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>