More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6419 on replicon NC_010517
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.1 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
216 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  35.85 
 
 
217 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  33.17 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.05 
 
 
217 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
220 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  34.43 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.19 
 
 
241 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
219 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
215 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.01 
 
 
226 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 
217 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
226 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  31.43 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  33.01 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.1 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
214 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  31.86 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.53 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.18 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.83 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.24 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  26.85 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  29.95 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  32.16 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  29.58 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  30.33 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.3 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  28.37 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  37.58 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.03 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  28.87 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.36 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.49 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.77 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.09 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.77 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  27.73 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>