More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5757 on replicon NC_011760
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.9 
 
 
216 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.9 
 
 
216 aa  316  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.94 
 
 
211 aa  187  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  45.1 
 
 
225 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.39 
 
 
226 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.88 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.9 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.9 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.9 
 
 
226 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.9 
 
 
226 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  37.96 
 
 
240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 
234 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 
214 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.55 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.88 
 
 
309 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  35.61 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  34.93 
 
 
267 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.23 
 
 
212 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
217 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
221 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  33.97 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
212 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.74 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  32.69 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.79 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.16 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.81 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.79 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.99 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.91 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
209 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  36.79 
 
 
212 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  34.72 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.96 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  36.87 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.51 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  35.85 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.88 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.26 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  30.77 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.84 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  35.32 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  32.86 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.5 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  27.1 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.64 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
276 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.05 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  29.32 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  29.61 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.43 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.17 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  28.64 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>