More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1906 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.77 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  63.41 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.27 
 
 		 234 aa  268  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.2 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.81 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.96 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.63 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.87 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.55 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.27 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.62 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.92 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.57 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.15 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  37.62 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  33.18 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  35.21 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  33.8 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  33.01 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.91 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  34.88 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.49 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.49 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.19 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  32.85 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.9 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.54 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  30.23 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.06 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.61 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.54 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  37.02 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.06 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.76 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.76 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  34.63 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.18 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.82 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  35.58 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.97 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.91 
 
 		 276 aa  78.2  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.8 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.94 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.94 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  27.67 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.52 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  27.59 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  26.6 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.4 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.54 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  26.42 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>