More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3840 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.86 
 
 		 226 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.42 
 
 		 224 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.09 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.65 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  78.32 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.9 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.38 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.51 
 
 		 216 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.81 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.78 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  34.76 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.13 
 
 		 309 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  34.63 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.32 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  35.58 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  34.47 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.04 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  32.69 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.15 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.31 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.56 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  34.88 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.07 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.72 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  26.55 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.09 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  31.25 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  35.34 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.82 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  26.96 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.52 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.09 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  30.95 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  37.12 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  29.36 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  30.48 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  32.56 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.32 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  31.96 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  36.36 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  33.75 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  27.32 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.97 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>