More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5120 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  92.63 
 
 
217 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.72 
 
 
232 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.52 
 
 
215 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  45.67 
 
 
223 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 
216 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.51 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  36.92 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.16 
 
 
241 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
221 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.95 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.93 
 
 
219 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
216 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.94 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.19 
 
 
229 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.62 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.24 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
214 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.41 
 
 
223 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 
229 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 
229 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  35.12 
 
 
209 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.85 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  36.45 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  35.53 
 
 
267 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.7 
 
 
250 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  33.64 
 
 
309 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
226 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 
212 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  33.82 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  31.58 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  34.08 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
226 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  31.86 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  34.83 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  34.76 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.01 
 
 
209 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.03 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  37.11 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.74 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.86 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.1 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.88 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  33.33 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.01 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.67 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.84 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>