More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2637 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  100 
 
 		 203 aa  403  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.81 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  33.98 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  33.98 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.98 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.44 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.24 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.45 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.69 
 
 		 309 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.44 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.03 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  34.29 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.96 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.67 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  31.8 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.84 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  31.75 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.88 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35.11 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.82 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  38.57 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  30.95 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  29.77 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.27 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  29.25 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  30.35 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  29.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  26.73 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.27 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.49 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  30.89 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  28.14 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.35 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  23.74 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  23.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  31.15 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  26.87 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.56 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  30.92 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  33 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  30.54 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20580  hypothetical protein  31.76 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.247088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>