137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_08 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  36.14 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  37.62 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  34.65 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  34.43 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.49 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.26 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  25.6 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  26.77 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1410  hypothetical protein  24.6 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.499292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.64 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  26.42 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01091  hypothetical protein  24.6 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.535106  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.66 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0779  chromosome partitioning ATPase  21.31 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.352348  normal  0.0863707 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1345  hypothetical protein  23.72 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  29.93 
 
 		 309 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  23.4 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.84 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  31.05 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  26.19 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  30.95 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.46 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  24.04 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.66 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.81 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  23.83 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.83 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.7 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.81 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06541  chromosome partitioning ATPase protein  22.7 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.849142  normal  0.485277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.74 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.74 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  27.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  26.9 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  30.07 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  28.8 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  26.9 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>