178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0108 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  63.77 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  61.06 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  43.75 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  36.14 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  37.14 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.87 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.21 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  25.7 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.02 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.53 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.21 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.47 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.7 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.61 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  30.21 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  30.21 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  29.91 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.19 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  27.36 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  33.33 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  31.61 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  28.43 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  29.14 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  27.46 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  27.46 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  31.35 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.2 
 
 		 274 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  30.85 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  27.75 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  38.46 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.3 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.53 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4464  chromosome partitioning ATPase  24.55 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.763597 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.82 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  22.54 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.76 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.75 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  29.3 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  25.91 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  28.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.81 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>