133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4285 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  45.75 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.39 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  29.6 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  32.72 
 
 		 213 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  28.9 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  24.89 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  30.05 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  31.34 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  28.87 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.89 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  28.87 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  27.62 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5462  hypothetical protein  28.82 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  25.93 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  23.65 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  21.1 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  21.56 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  25.47 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  25.47 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  26.85 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  25.11 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  22.44 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  24.07 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.7 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  20.18 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  25.66 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.37 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  24.66 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  27.45 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  21.05 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  21.05 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  30 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  21.05 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.94 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.33 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  20.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  27.5 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.45 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  21.28 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.45 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  20.74 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.45 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  24.73 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.45 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  19.15 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  20.21 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.45 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  20.21 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  20.21 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  20.21 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  28 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  26.71 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.02 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.02 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  20.74 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  24.35 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.58 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.52 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.48 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.48 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>