More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2325 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  90.54 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  88.74 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  91.89 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  89.19 
 
 		 224 aa  400  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  88.74 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  87.39 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  87.39 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  87.39 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  87.39 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  88.29 
 
 		 222 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  88.29 
 
 		 222 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  88.74 
 
 		 222 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  88.29 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  87.39 
 
 		 222 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  76.13 
 
 		 222 aa  339  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  69.48 
 
 		 247 aa  308  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  69.68 
 
 		 231 aa  307  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  69.01 
 
 		 260 aa  307  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  69.95 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  69.48 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  69.48 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  70.42 
 
 		 285 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  70.28 
 
 		 247 aa  304  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  69.67 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  69.95 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  69.19 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  69.19 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  37.74 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  36.45 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  36.45 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.15 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.99 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.79 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  26.15 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.34 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  29.9 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  29.03 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  30.29 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.09 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  29.13 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.67 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  28.43 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  29.44 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  27.06 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.63 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  25.69 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.13 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  27.44 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.66 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>