More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pVir0025 on replicon NC_008770
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  57.01 
 
 
222 aa  222  4e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  44.71 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.44 
 
 
213 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.56 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.86 
 
 
213 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
216 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
213 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  28.44 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  30.32 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  25.84 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  26.79 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.39 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 
214 aa  92  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  25.76 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.09 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.77 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  25.47 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  27.92 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  27.86 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.61 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.41 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  25.5 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  26.37 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  26.87 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  27.22 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  27.22 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.77 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  25.98 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.6 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  27.78 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  24.87 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  27.78 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.52 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  25.68 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  25.68 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  25.68 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  26 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  27.09 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  25.68 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  27.04 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30.09 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  26.11 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.04 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  25.56 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  25.56 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  26.6 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.1 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.19 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  33.81 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.8 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.14 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>