More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2788 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.77 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.12 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.77 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  41.46 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  37.02 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  35 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  36.82 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  34.43 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  33.66 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  34 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  35.15 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.54 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  31.4 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  32.85 
 
 		 267 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  32.83 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.81 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  32.76 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  33.53 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  31.11 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  31.79 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  31.21 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  31.21 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  31.21 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  31.21 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  34.3 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  31.13 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  32.37 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  31.69 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  31.69 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  31.69 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  32.39 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  31.69 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.52 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  31.25 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  31.43 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  30.9 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  31.1 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  31.07 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.72 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  30.46 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  31.25 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  31.87 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.37 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  31.28 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  30.69 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  31.8 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  34.08 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  26.49 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  30.35 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  31.09 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>