More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1451 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00188654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  89.19 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  89.64 
 
 		 222 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  86.94 
 
 		 222 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1662  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00377419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1699  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2680  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1677  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2428  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.138637  normal  0.0455143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2498  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.0447038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2590  hypothetical protein  90.99 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.300803  normal  0.0153957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2808  hypothetical protein  90.09 
 
 		 222 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  90.09 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1285  hypothetical protein  90.09 
 
 		 222 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.016663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2431  hypothetical protein  88.74 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  75.23 
 
 		 222 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  70.89 
 
 		 248 aa  310  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  70.42 
 
 		 280 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  70.42 
 
 		 285 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  70.89 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  68.33 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  69.95 
 
 		 260 aa  304  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  69.95 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  69.48 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  69.95 
 
 		 260 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  70.28 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  69.19 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  69.19 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  66.52 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  37.74 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  34.58 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  34.58 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.49 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  27.88 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  31.19 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  26.56 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.77 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  29.03 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.04 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  29.21 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  28.43 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.69 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.19 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  37.5 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.7 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  25.69 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  27.48 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.62 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  29.33 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.86 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  28.85 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  27.23 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.48 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>